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Introduction to Advanced Research Computing (ARC) [CQ - U. McGill]

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Room 3120, Trottier Building

McGill Campus

3630 Rue University

Montréal, QC H3A 0C6

Canada

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Description

This workshop will be given in English by Pier-Luc St-Onge, an HPC analyst working at McGill HPC, Calcul Québec.

Summary

This workshop will first present what is a super computer, what is advanced research computing (ARC) and why they are needed. This is followed by a description of resources available at Compute Canada and how to get access. Participants will be invited to connect to a cluster and do some exercises: to transfer data, submit a job and get results.

Requirements

Some knowledge of the Unix environment : mkdir, cd, ls, nano, mv, rm, env.

Outline

  • Introduction to Advanced Research Computing (what, why)
    • Compute Canada and Calcul Québec (how to get access)
  • Transferring files to/from the cluster with Globus
  • Using modules (Scientific Software)
  • The scheduler (how to submit and monitor a simple job)
  • Common errors, best practices, recommendations


FAQ

  • Q: If I bring my own laptop, what software should I install?
    A: Depending on your operating system:
    1. Linux: find the built-in terminal application
    2. Mac OS X: find the built-in terminal (Apple key + Space, type "terminal")
    3. Windows: install MobaXterm, Git for Windows or PuTTy+Xming


How can I contact the organizer if I have questions?

Please email support@calculquebec.ca


Cet atelier sera donné en anglais par Pier-Luc St-Onge, un analyste en calcul informatique de pointe de McGill HPC, Calcul Québec.

Résumé

Cet atelier présentera d'abord ce qu'est un superordinateur, ce qu'est le calcul informatique de pointe (CIP) et pourquoi certains domaines de recherche en ont besoin. Ce sera suivi d'une description des ressources à Calcul Canada et de comment obtenir un accès. Les participants seront invités à se connecter à une grappe de calcul et à faire quelques exercices : transfert de données, soumission de tâche, récupération des résultats.

Prérequis

Quelques connaissances de l'environnement Unix : mkdir, cd, ls, nano, mv, rm, env.

Plan de cours

  • Introduction au calcul informatique de pointe (quoi et pourquoi)
    • Calcul Canada et Calcul Québec (comment avoir accès)
  • Transfert de fichiers à partir de/vers la grappe de calcul avec Globus
  • Utilisation de modules (logiciels scientifiques)
  • Utilisation de l’ordonnanceur (comment soumettre et surveiller une tâche simple)
  • Erreurs courantes, bonnes pratiques et recommandations

FAQ

  • Q: Si j'apporte mon ordinateur portatif, quel(s) logiciel(s) dois-je installer
    R: Selon votre système d'exploitation:
    1. Linux: un terminal est généralement inclus avec une distribution Linux (accessoire ou outil administrateur)
    2. Mac OS X: un terminal est inclus (touche Pomme + Espace, entrez "terminal")
    3. Windows: installez MobaXterm, Git for Windows ou PuTTy+Xming


Comment puis-je joindre les organisateurs si j'ai des questions?

Par courriel: support@calculquebec.ca

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Room 3120, Trottier Building

McGill Campus

3630 Rue University

Montréal, QC H3A 0C6

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